Forum

Spectroscopie RMN î...
 
Notifications
Clear all

Spectroscopie RMN în studiu reacții biochimice, chiar?

4 Posts
4 Users
0 Reactions
6 Views
Posts: 3
Topic starter
(@luca.racovita)
Active Member
Joined: 2 săptămâni ago

A mai pățit cineva să folosească spectroscopie RMN pentru studiu reacții biochimice? Mă tot lupt cu ideea asta de câteva săptămâni și sincer, nu știu dacă e doar impresia mea, dar pare ca e o metodă promițătoare, chiar dacă nu e foarte răspândită în laboratorul nostru.

Am citit câte ceva despre aplicarea NMR în monitorizarea schimbărilor conformaționale ale moleculelor în timpul reacțiilor, dar încă nu am avut ocazia să încerc pe propriile probe. La facultate ne-au dat niște exemple de stuții recente, dar parcă tot lipsește ceva pentru a înțelege dacă se poate aplica pe reacții complexe sau numai pe compuși izolați.

Când am discutat cu profesorii, mi-au spus că metodele sunt foarte sensibile, dar și destul de costisitoare și și-au cam pus sechele în utilizare pentru reacții biochimice complexe. Nu știu dacă e doar problema echipamentului sau dacă practic se pot obține rezultate relevante pentru a studia, de exemplu, cinetica sau mecanismul de reacție.

M-a interesat în special aspectul de a urmări modificările acilurilor sau grupurilor funcționale, dar e greu de spus dacă RMN-ul poate fi folosit pentru a detecta evenimente dinamice din reacțiile din organism, nu doar în modelii in vitro.

Părerea voastră? Ați avut experiențe directe sau cunoștințe din literatură despre asta? Aștept sfaturi sau recomandări, chiar mi-ar plăcea să înțeleg dacă merită să insiști mai mult pe această direcție sau să încerc alte metodologii.


3 Replies
Posts: 250
(@abigail)
Estimable Member
Joined: 5 luni ago

Salut, Luca! Îți împărtășesc experiența mea cu spectroscopie RMN, deși trebuie să recunosc că nu am folosit direct pentru reacții biochimice complicate, ci mai mult în studii structurale și pentru monitorizarea interacțiunilor moleculare.

Totuși, pot să spun că RMN-ul are un potențial mare pentru studierea modificărilor dinamice, dar, într-adevăr, aspectul costurilor și al sensibilității sunt puncte de luat în considerare. În cazul reacțiilor complexe, devine mai dificil să se urmărească în timp real fiecare pas, deoarece reacțiile biochimice pot implica procese rapid sau regii multiple, ceea ce necesită echipamente de înaltă performanță și metode de preparare a probelor foarte bine optimizate.

Pe de altă parte, tehnici avansate de NMR, cum ar fi spectroscopia de reacție în timp real sau NMR-ul cu acțiune rapidă, pot oferi informații foarte valoroase despre mecanism și kinetică, dar necesită o investiție semnificativă în echipament și expertiză.

În ceea ce privește monitorizarea evenimentelor dinamice din organism, din ceea ce știu, unele studii au folosit NMR in vivo pentru a urmări metabolismul, dar asta e încă o frontieră relativ complicată și limitată de echipament și de sensibilitate.

Recomandarea mea ar fi să începi cu studii pilot pe modele simple, chiar și cu probe in vitro, ca să prinzi dacă metoda poate oferi informațiile de care ai nevoie, înainte să investești prea mult în echipament sau în certitudini. În același timp, nu pierde din vedere și alte tehnici complementare, precum spectrometria de masă sau tehnicile de imagistică moleculară, care pot să-ți ofere o perspectivă mai largă asupra reacțiilor biochimice dinamice.

Mi-ar plăcea să aflu și părerea altora cu experiență directă în utilizarea NMR pentru reacții biologice! Oricum, e o direcție promițătoare, și cred că, dacă găsești proiectul potrivit, merită să insiști. Succes!


Reply
Posts: 252
(@alex.craciunescu)
Estimable Member
Joined: 2 ani ago

Salut, Luca și Abigail! Îmi place că discuția s-a deschis pe această temă, care chiar e un teren de explorare destul de interesant în cercetare.
Din experiența mea, spectroscopie RMN în studii biochimice și de reacție în timp real poate fi o metodă cu adevărat puternică, dar, într-adevăr, trebuie abordată cu atenție din mai multe unghiuri.

Eu am lucrat cu NMR pentru monitorizarea schimbărilor conformaționale în reacții, dar mai mult în contexte de studii structurale sau de interacțiuni. În cazul reacțiilor dinamice, cele mai complicate sunt fazele de pregătire a probelor și, ca să fii sincer, și interpretarea datelor, mai ales dacă reacția nu e clarizată sau dacă modificările sunt subtile.

Un aspect important pe care l-am remarcat e că tehnicile de NMR cu acțiune rapidă sau cele cu spectroscopie de reacție (reaction-monitoring) pot oferi rezultate interesante, dar necesită echipamente specializate și calibrare foarte precisă. În plus, trebuie să ai în vedere faptul că, pentru reacții foarte rapide sau foarte complexe, alte metode precum spectrometria de masă (mai ales în variante rapide, ca MS în flux) pot fi mai agile și mai accesibile pentru monitorizarea kinetică.

Ce vreau să accentuez e că, dacă vizezi să folosești NMR pentru studii în reacții biochimice complexe, e nevoie de colaborări interdisciplinare sau de acces la echipamente de top, dar rezultatele pot justifica investiția dacă te ajută să elucidazi mecanisme sau modificări conformaționale subtile.

Personal, recomand să începi cu studii pilot, pe probe mai simple sau cu reacții bine caracterizate, pentru a testa potențialul tehnicii în contextul tău, și abia apoi să avansezi spre studii mai complexe. Și, desigur, combinarea metodologiilor (de exemplu, NMR + spectrometrie de masă) e, după mine, cea mai bună abordare pentru a obține o perspectivă completă.

Pentru ceea ce-ți doresc, Luca, cred că merită s-o explorezi, totul ține de echipa cu care lucrezi și de resursele pe care le ai la dispoziție. Îi încurajez să nu renunți la această idee și să cauți colaborări sau suporturi financiare dacă vrei să mergi mai departe.

Succes și aștept cu interes să mai schimbăm păreri!


Reply
Posts: 225
(@adela.adam)
Estimable Member
Joined: 2 ani ago

Salutare tuturor,

Mă alătur și eu discuției cu entuziasm, fiindcă subiectul abordat este cu adevărat fascinant și foarte actual. Într-adevăr, spectroscopie RMN în context biochimic e un domeniu în plină dezvoltare, dar și cu provocări importante.

Din experiența proprie, pot spune că, deși metodele NMR de înaltă performanță (cum ar fi reacția în timp real sau spectroscopia rapidă) pot oferi informații extrem de valoroase despre cinetică și mecanism, ele sunt încă destul de limitate în aplicabilitatea lor pentru reacții foarte rapide sau foarte complexe, mai ales din cauza costurilor și a complexității interpretării datelor.

Totodată, trebuie să menționez un aspect esențial: stabilitatea probei și caracteristicile reacției studiate. În cazul reacțiilor din organism sau în condiții fiziologice, intervenția tehnicii NMR este mai dificilă, dar nu imposibilă. Grupuri de cercetare au făcut progrese spectaculoase în monitorizarea metabolismului sau în studii de farmacocinetică, de exemplu, însă aceste studii sunt, în general, realizate în colaborare cu specialiști în domeniul imagisticii și tehnicilor avansate de analiză.

Pentru cineva care începe, recomandările sunt clare: încercați să începeți cu modele simple, să validați metodologia pe probe in vitro și să construiți treptat. În același timp, nu ezitați să integrați și alte tehnici, precum spectrometria de masă sau chiar tehnicile de imaging molecular, pentru o perspectivă mai holistică asupra fenomenelor studiate.

Cred că visul de a urmări dinamic modificările biochimice în timp real în mediul celular sau organism este un obiectiv pe termen lung, dar care, cu pași mici, poate deveni realizabil. E nevoie de colaborări interdisciplinare, investiție și răbdare, dar rezultatele pot fi cu adevărat revoluționare.

Vă sfătuiesc să urmăriți ultimele publicații din domeniu și să nu ezitați să participați la conferințe sau workshop-uri specifice, unde se discută noile tehnologii și inovații.

Mult spor și doresc să auzim și povești de succes pe această linie!
Adela Adam


Reply
Share: